<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN"> <html><head><!-- saved from url=(0022)http://internet.e-mail --> <meta name="organization" content="INRIA"> <meta name="keywords" content="international"> <meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=ISO-8859-1"> <title>INRIA - international</title></head> <body bgcolor="#ffffff"> <p align="center"><font color="#000066" face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><font size="+2">Direction des Relations Internationales (DRI)</font></font></p> <h1 align="center"><font color="#000066" face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><strong><font size="6">Programme INRIA "Equipes Associées" <br> <font color="#666666">/</font> <font color="#666666">INRIA "Associate Teams" Programme </font></font></strong></font></h1> <p>&nbsp;</p> <h2 align="left"><font color="#000066" face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">I. DEFINITION</font></h2> <div align="center"> <table border="1" cellspacing="0" width="70%"> <tbody> <tr> <td width="43%"> <p><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><b><font size="7"><font size="4">EQUIPE ASSOCIEE <br> <font color="#666666">/ ASSOCIATE TEAM</font> </font><br> </font><em><font size="2"><br> </font> </em> </b></font></p> </td> <td width="57%"> <p><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><em><font size="5">SPAMODIS <br> <em><font size="2">Spatial modelling of Diseases </font></em></font></em></font></p> </td> </tr> <tr> <td> <div align="right"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">sélection</font></div> </td> <td><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><strong> 2010</strong></font></td> </tr> </tbody> </table> <p>&nbsp;</p> <table border="1" bordercolor="#cccccc" cellpadding="1" cellspacing="0" width="100%"> <tbody> <tr bgcolor="#99cc99"> <td width="33%"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">Equipe-Projet INRIA : MASAIE</font></td> <td width="33%"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">Organisme étranger partenaire <font color="#333333"> : CDM of MITACS</font>:</font></td> <td width="33%"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"> Autre participant Français</font>: EPI ANUBIS</td> </tr> <tr bgcolor="#99cccc"> <td height="22"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">Centre de recherche INRIA : Nancy Grand Est<br> Thème INRIA : Thème 4</font></td> <td><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">Pays <font color="#333333">/ Country</font> : Canada</font></td> <td height="22"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">Centre de recherche INRIA : Bordeaux Sud-Ouest<br> Thème INRIA : Thème 4</font></td> </tr> </tbody> </table> <font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">&nbsp; </font> <table border="1" bordercolor="#cccccc" cellpadding="0" cellspacing="0" width="100%"> <tbody> <tr> <td>&nbsp;</td> <td bgcolor="#99cc99"> <div align="center"><font color="#990000" face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">Coordinateur français</font> <font color="#663333" face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">/ French Coordinator</font> </div> </td> <td bgcolor="#99cc99"> <div align="center"><font color="#990000" face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">Coordinateur étranger</font> <font color="#663333" face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">/ Partner Coordinator </font></div> </td> <td bgcolor="#99cc99"> <div align="center"><font color="#990000" face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">Autre Participant Français</font> </div> </td> </tr> <tr> <td><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">Nom, prénom <font color="#666666">/ First name, Given name </font></font></td> <td> SALLET Gauthier</td> <td> ARINO Julien</td> <td> DUCROT Arnaud</td> </tr> <tr> <td><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">Grade, statut <font color="#666666">/ Position</font> </font></td> <td>Professeur des universités, responsable EPI MASAIE</td> <td>Assistant Professor</td> <td>Maître de Conférences</td> </tr> <tr> <td><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">Organisme d'appartenance <font color="#666666">/ Home Institution </font><br> <font size="1"><em>(précisez le département et/ou le laboratoire)</em></font></font></td> <td>Université de Metz, MASAIE</td> <td>University of Manitoba, Department of Mathematics </td> <td>Université de Bordeaux 2, ANUBIS </td> </tr> <tr> <td><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">Adresse postale <font color="#666666">/ Postal address</font></font> </td> <td>INRIA MASAIE, université de Metz, Ile du Saulcy, 57045 Metz cedex 1, France</td> <td> Department of Mathematics 342 Machray Hall University of Manitoba Winnipeg, Manitoba, R3T 2N2 Canada </td> <td>Institut de Mathématiques - MAB, Université Bordeaux 1, 351, cours de la libération, 33405 TALENCE cedex </td> </tr> <tr> <td><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">URL <font color="#666666">/ Website</font></font> </td> <td><a href="http://iggidr.perso.math.cnrs.fr/masaie.html"><em> site MASAIE </em></a> <p></p> </td> <td><a href="http://www.mitacs.ca/main.php?mid=10000015&amp;pid=75&amp;proid=28&amp;lang=fr"><em> site CDM MITACS </em></a> <p></p> </td> <td><a href="http://www.inria.fr/bordeaux/recherche/les-equipes-de-recherche/ANUBIS_page"><em> site ANUBIS </em></a> <p></p> </td> </tr> <tr> <td><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">Téléphone <font color="#666666">/ Telephone</font></font> </td> <td>+33 387 54 72 79</td> <td>(204) 474-6927</td> <td>33 (0)5 40 00 37 16</td> </tr> <tr> <td><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">Télécopie<font color="#666666"> / Fax</font></font> </td> <td> 33 387 54 72 77</td> <td> (204) 474-7611 </td> <td>(+33) 5 40 00 2626 </td> </tr> <tr> <td><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">Courriel <font color="#666666">/ Email</font></font> </td> <td>sallet@loria.fr</td> <td>arinoj@cc.umanitoba.ca</td> <td>ducrot@sm.u-bordeaux2.fr</td> </tr> </tbody> </table> <div align="justify"> <p><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><em><font color="#333333" size="2"> </font></em><font size="2"><font color="#000000" size="4"><b><br> <br> La proposition en bref</b></font></font></font> <font color="#666666" face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif" size="4"><strong>/ The proposal in brief</strong> </font></p> </div> <table border="1" bordercolor="#cccccc" cellpadding="0" cellspacing="0" width="100%"> <tbody> <tr> <td> <p><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif" size="3">Titre de la thématique de collaboration <i><font size="2">(en français et en anglais)</font></i> <font color="#666666">/ Title of the collaboration theme <em>(in French and in English) </em></font></font><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><em>: Propagation spatio-temporelle des épidémies, <font color="#666666">/ Dynamics and spatial spread of epidemics<em> </em></font></em></font></p> <font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><em> </em></font></td> </tr> <tr> <td> <p><font color="#000099" face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><font color="#000000" size="3">Descriptif <i><font size="2">(environ 10 lignes)</font></i><b><b> / </b></b><font color="#666666">Description <em>(approximately 10 lines)</em> </font><b><b>: </b></b></font></font></p> <p>Développer un ensemble de schémas de modélisation. Ceux-ci sont élaborés de manière à s adapter à divers types de dynamique et de gestion des maladies, notamment: la modélisation, la simulation et la prédiction, en temps réel, de maladies contagieuses telles que l'hépatite B, la tuberculose; l évaluation de l efficacité de différentes stratégies d intervention; la modélisation de l impact d une épidémie, comme la grippe, en vue de dégager l état de préparation des mesures de santé publique; et enfin, l étude de maladies à transmission vectorielle comme le paludisme ou la schistosomiase à l aide de l efficacité prédictive de la modélisation mathématique. Ce projet s'intéressera plus particulièrement aux hétérogénéités dues aux différences géographiques. Cela concerne par exemple la structuration génétique des populations parasitaires (Plasmodium falciparum) ou le rôle de l'irrigation dans la transmission de la schistosomiase (Bilharsiose) ou la transmission due aux transports aériens<br> </p> This project develops a variety of modeling templates. These templates are designed to fit different types of disease dynamics and management, including: real-time modeling, simulation and prediction of communicable diseases such as Hepatitis B, Tuberculosis; evaluation of the effectiveness of different intervention strategies; modeling the impact of a pandemic, such as influenza, to reveal the preparedness of public health policy; and the study of vector-borne diseases such as Malaria or Schistosomiasis (Bilharzia) using the predictive power of mathematical modeling and its integration into a national surveillance system. This project will concentrate on geographic sources of heterogeneities. We will study for example the genetic structuration of parasites population (Plamodium falciparum) or the role of irrigation in schistosomiasis transmission or transmission of influenza induced by global airline transportation </td> </tr> </tbody> </table> <h2 align="center"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><b><strong><font color="#000066">Présentation détaillée de l'Équipe Associée</font></strong></b><br> <font color="#666666">Detailed presentation of the Associate Team</font></font> </h2> <p align="left"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><b><font color="#990000">1. Objectifs scientifiques de la proposition</font></b> <i>(1 à 2 pages)<br> </i><font color="#663333"><strong>/ Scientific goals of the proposal</strong><i> (1 to 2 pages) </i></font></font></p> <p align="left"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"> <br> The spread of an infectious disease involves characteristics of the agent (e.g. virus, bacteria, etc.), the human host (e.g., susceptibility due to genetic, environmental and other factors) and the environment (e.g. network) in which transmissions take place. The purpose of modeling infectious diseases, in relation to public health, is to evaluate the agent-host-environment interface and efforts to alter the interface through intervention to our advantage, be they preventive or therapeutic in nature.<br> <br> Mathematical epidemiology has a long history, but in recent years researchers in this area have developed more complex and biologically relevant models that have become important for influencing the design of control programs. Some of these models have been developed for new diseases [e.g., severe acute respiratory syndrome (SARS), Malaria, some include new treatments (e.g., antiviral drugs for influenza), some involve evolutionary aspects (e.g., drift of influenza A virus) and some consider new patterns of social behavior and travel. Recent mathematical approaches include deterministic compartmental models (including metapopulation models), PDE models. These techniques are often complemented with computer simulations, which use demographic and disease incidence data. Nevertheless, there remain many challenging problems in the understanding of disease transmission and spread.<br> <br> <br> Classical deterministic epidemic models implicitly assume that space is homogeneous, and so do not include spatial variation. There are, however, many reasons why epidemic models should include spatial variation. Firstly, initial conditions of disease are often heterogeneous, with disease spreading geographically with time. Secondly, the environment is heterogeneous both in a geographical sense and in a human sense with birth rates, death rates and health care facilities varying with location. Thirdly, different species have different travel rates, a factor that is especially important for diseases involving many species (for example the case of r vector transmitted diseases). Fourthly, for human diseases, social groupings and mixing patterns vary with geography and age. This can be illustrated by comparing humans in a hospital setting with those in isolated communities. Currently most humans live in cities and travel along defined routes. These influence the spatial spread of disease, for example, SARS in 2003 was spread by air travellers. Continuous spatial models with continuous time yield partial differential equations of reaction-diffusion type. Discrete spatial models with continuous time yield systems of ordinary differential equations, which are metapopulation models involving movement of individuals between discrete spatial patches. Such compartmental models have been discussed for infuenza spread due to air travel between cities by Hyman and LaForce using a model with structure similar to that developed by Rvachev and Longini . Such models have also been formulated for measles and influenza by Sattenspiel and coauthors, further analyzed by Arino and coauthors, Sallet and coauthors and Wang and coauthors. Recently, there has been increased interest in deterministic metapopulation disease models that do not reduce to the familiar reaction diffusion systems. On the one hand, numerical integration of large systems of ordinary differential equations has now become efficient, owing to advances in computational power. This has led to a number of numerical investigations of spatial metapopulation models These deterministic, spatial disease models have the advantage that they allow for the investigation, either analytically or numerically, of various spatio-temporal control strategies. <br> <br> The project will focus on metapopulation models and diffusion models, to study the influence of spatial variation on the propagation of infectious diseases. We will also study the influence of drug resistances (antiviral resistances for influenza, drug resistance for malaria parasites). We will emphasize on some infectious diseases for which spatial heterogeneities play a crucial role : Tuberculosis, Influenza, Malaria, Schistosomiasis. </font></p> <p align="left"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"> <font color="#666666"><br> A short description of the scientific tasks. </font><br> <br> We will study metapopulation models to address the following issues : <br> - Understand how the basic reproduction ratio is influenced by movements of individuals and/or migration of vectors <br> - Answer to some open problems in metapopulation models : e.g. existence and uniqueness of endemic equilibria and their stability - incorporation of travel time <br> - vaccination <br> - Understand global patterns of human travel via commercial airlines as a way to predict how emerging infectious diseases are most likely to spread around the world - and consequently apply this knowledge to help the world's cities and countries better prepare for and respond to global infectious disease threats of tomorrow.<br> - Understand how is built the structuration of the Plasmodium falciparum population in Africa. <br> - How drug resistance is linked to the preceding problem. <br> </font></p> <p align="left"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><b><font color="#990000">2. Présentation des partenaires</font></b> <i>(1 page environ par partenaire)</i> <br> / <font color="#663333"><strong>Partners presentation</strong> <em>(1 page per partner) </em></font></font></p> <p align="left"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><img src="Soumission2010_fichiers/here_rouge.gif" height="12" width="11"> Equipe MASAIE <br> The overall objective of MASAIE is to develop and apply methods and tools of control theory and dynamical systems for the mathematical modeling in epidemiology and immunology. The problem at issue is twofold. The first objective is to obtain a better understanding of epidemiological and immunological systems. The second objective is to mathematically study problems arising naturally when addressing questions in the fields of epidemiology and immunology. In our opinion our two endeavors operate in a synergic way : new problems will appear in control theory and their study will give new tools to epidemiology and immunology.<br> <br> Fields of application <br> <br> 1. Intra-host models for malaria.<br> 2. Metapopulation models considering the dynamics of Plasmodium falciparum causing tropical malaria in human populations, and the development of drug resistance.<br> 3. Modeling the dynamics of immunity in human populations in endemic areas. Models describing the intra-host parasite dynamics, considering the development and loss of immunity.<br> 4.Spread of epidemics of arbovirus diseases (dengue, chikungunya ...)<br> 5.Disease leading to structured model to allow to take in account the effect of asymptomatic carriers, differential infectivity or differential susceptibility (HBV, Meningitis ...)<br> One of the challenge of the project is to ensure the relevance of these models. It is Important to closely involve the  end users" (specialists in the fields, experimenters, observers, physicians, epidemiologists, entomologistsÉ) and  providers" (Mathematicians, numerical, statisticians, computer scientists,...). Users are able to bring a critical evaluation on the quality of results, to validate them or exploit them further. For example we want to understand the genetic diversity and structure of African Plasmodium falciparum population. The spread of drug resistance is due to gene flow and the scale of P. falciparum population structure. A better understanding of P. falciparum population genetics is necessary to adjust control measures. The findings of Rogier et al [23] provide evidence for support structured P. falciparum populations in Africa, and suggest that malaria epidemiology in urban areas depends on local transmission, geographic isolation, and parasite flow between the city and the surrounding rural areas. <br> <br> Chercheurs impliqués :<br> <br> </font><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">Gauthier</font><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"> Sallet, professeur des universités, team leader MASAIE (<a href="cvSallet.pdf">voir cv</a>)<br> </font><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">Abderrahman</font><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"> Iggidr, CR1 INRIA <br> </font><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">Philippe</font><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"> Adda, Maître de Conférences&nbsp;</font></p> <p align="left"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"> Etudiants :<br> </font></p><div style="text-align: justify;"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">Aziz</font><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"> Fall, Université Gaston Berger, Saint-Louis, Sénégal (HBV)</font><br><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">Bichara Derdei, UPV-Metz (</font><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">intra-host parasite dynamics)</font><br><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">Josephine </font><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">Kagunda, University of Nairobi, Kenya (Highlands malaria)</font><br><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"> </font><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">Lena</font><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"> Tendeng, Université Gaston Berger, Saint-Louis, Sénégal (Schistosomiasis)</font><br><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">Berge</font><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"> Tsanou, Université Yaoundé I, (metapopulations)</font></div><p align="left"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">&nbsp;<br> Des étudiants en cotutelle sont prévus avec le MITACS <br> <br> </font></p> <p align="left"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><img src="Soumission2010_fichiers/here_rouge.gif" height="8" width="11"> Equipe CDM (Centre for Disease Modelling of MITACS)<font color="#666666"><br> </font> </font><br> Le Centre pour la modélisation des maladies (CMM ou Centre for Disease Modelling -CDM- en anglais) a été créé en 2008 pour assurer la pérennité du projet MITACS de modélisation des maladies infectieuses, et reprend presque à l'identique la structure de ce projet initié lors de l'épidémie de SRAS (syndrome respiratoire aigu sévère) qui avait fait 47 morts en Ontario en 2003. Le CMM est basé à l'université York (Toronto), mais fonctionne sous la forme d'un réseau, avec 27 membres à temps plein répartis dans 17 universités et instituts au Canada, secondés d'une demi-douzaine de membres associés.<br> <br> Les membres du CMM sont en majorité des mathématiciens, mais il compte également des praticiens de la sante publique, un virologue/immunologiste et plusieurs statisticiens. Cette pluralité fait que le CMM a depuis quelques années été impliqué dans les processus de décision en santé publique au Canada. Des membres du CMM siègent dans diverses instances de sante publique fédérales mais aussi provinciales (Colombie Britannique, Manitoba, Ontario). Lors de la récente pandémie, par exemple, des membres du CMM ont été consultés dans les processus de décision concernant l'utilisation d'antiviraux et de vaccins dans les provinces du Manitoba et de l'Ontario ainsi qu'au niveau fédéral. <br> <br> Les domaines d'intérêt des membres du CMM sont variés et couvrent une grande partie de l'épidémiologie mathématique: maladies humaines (grippe saisonnière et pandémique, SRAS, tuberculose), animales (grippe aviaire), à vecteurs (paludisme, virus du Nil), mais aussi immunologie, maladies du sang, dynamique évolutionnaire des virus, etc. Les méthodologies employées vont des statistiques aux systèmes d'équations aux dérivées partielles avec termes non locaux, en passant par les équations différentielles ordinaires ou stochastiques ou encore la simulation multi-agents et l'emploi de systèmes d'information géographique (SIG). <br> <br> Le CMM et le projet MITACS auquel il succède ont été depuis leur création très impliqués dans les activités de formation, que ce soit par l'accueil de post-doctorants, l'encadrement d'étudiants ou l'organisation d'écoles thématiques. Ainsi, depuis 2003, ce sont 10 post-doctorants et plus de 45 étudiants (du niveau Bac+4 à la thèse) qui ont été directement formés par le réseau, sans compter plus de 300 étudiants qui ont participé à l'une des écoles organisées par le CMM: Banff 2004, York 2006, Xi'an (Chine) 2006, CDC Atlanta 2007, Edmonton 2008, Ottawa 2009, Banff 2009 et Yaoundé 2009. <br> <br> Le CMM est aussi très actif dans la diffusion des résultats et le partage des connaissances, par le biais de publications et par l'organisation de séminaires, groupes de travail et conférences. De 2004 à 2008, les membres du CMM ont publié 242 papiers dans des revues à comité de lecture et ont édité plusieurs livres et numéros spéciaux. Des séminaires sont régulièrement organisés dans les villes comportant plusieurs membres (Toronto, Winnipeg), auxquels s'ajoutent d'occasionnels séminaires transmis par internet. Depuis 2004, plus d'une douzaine d'évènements ont été directement organisés par le CMM: conférences internationales, mais aussi réunions de travail thématiques impliquant généralement une part égale de modélisateurs et de responsables de la santé publique. <br> <br> Au niveau des coopérations internationales, le CMM a des liens étroits avec la Chine, et a organisé un programme thématique Sino-Canadien sur la modélisation des maladies de Mai 2007 à Mars 2010, qui a donné lieu à de nombreuses visites de travail et à plusieurs conférences. Le CMM a aussi des relations privilégiées avec le groupe de Carlos Castillo-Chavez à Arizona State University (organisation conjointe de deux conférences internationales et de deux réunions de travail), et compte des collaborateurs fréquents au sein des CDC (Centres de contrôle des maladies) de Chine, de Taïwan et des USA. <br> <br> <br> <br> Chercheurs impliqués</font><br> <br> <font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><a href="http://www.math.umanitoba.ca/%7Ejarino/">Julien Arino</a><br> University of Manitoba (voir <a href="cv_arino_moderncv.pdf">cv de J. Arino</a>)</font></p><p align="left"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">Dr. <a href="http://www.math.yorku.ca/%7Ewujh" target="_blank">Jianhong Wu</a> <br> CRC in Applied Mathematics<o:p> <br> </o:p><br> <a href="mailto:belair@CRM.UMontreal.CA">Jacques Belair</a><br> Centre for Nonlinear Dynamics Département de Mathématiques Université de Montréal <br> <br> <a href="http://www.umanitoba.ca/science/mathematics/new/faculty/html/arino.html" target="_blank"><span class="SpellE">Fred </span> <span class="SpellE">Brauer</span></a> <br> Department of Mathematics, University of British Columbia <br> <br> <a href="href=" http://www.mast.queensu.ca/%7etday="" target="_blank"><span class="SpellE">Troy </span> <span class="SpellE">Day</span></a> <br> Canada Research Chair in Mathematical Biology Departments of Mathematics &amp; Biology Jeffery Hall, Queen's University <br> <br> <a href="mailto:dean@stat.sfu.ca" target="_blank"><span class="SpellE">Charmaine</span> <span class="SpellE">Dean</span></a> <br> Department of Statistics and Actuarial Science Simon Fraser University Burnaby, <br> <br> <a href="mailto:david.fisman@gmail.com%20" target="_blank"><span class="SpellE">David</span> <span class="SpellE">Fisman</span></a> <br> Child Health Evaluative Sciences Research Institute of the Hospital for Sick Children Medical Epidemiologist Ontario Public Health Laboratories Branch <br> <br> <a href="mailto:michael.gardam@uhn.on.ca%20" target="_blank"><span class="SpellE">Michael</span> <span class="SpellE">Gardam</span></a> <br> Director, Infection Prevention and Control Medical Director Tuberculosis Clinic University Health Network 200 Elizabeth St., ES3-428 Toronto <br> <br> <a href="mailto:jmheffer@mathstat.yorku.ca%20" target="_blank"><span class="SpellE">Jane </span> <span class="SpellE">Heffernan</span></a> <br> Department of Mathematics and Statistics York University Toronto, <br> <br> <a href="mailto:Zach_Jacobson@hc-sc.gc.ca%20" target="_blank"><span class="SpellE">Zachary</span> <span class="SpellE">Jacobson</span></a> <br> Applied Research and Analysis Directorate, Information, Connectivity and Analysis Branch Health Canada <br> <br> <a href="mailto:km.khan@utoronto.ca%20" target="_blank"><span class="SpellE">Kamran</span> <span class="SpellE">Khan</span></a> <br> Assistant Professor of Medicine Division of Infectious Diseases, St. Michael's Hospital Toronto, <br> <br> <a href="mailto:mli@math.ualberta.ca%20" target="_blank"><span class="SpellE">Michael</span> <span class="SpellE">Li</span></a> <br> Professor of Mathematics Department of Mathematical and Statistical Sciences University of Alberta <br> <br> <a href="mailto:madras@mathstat.yorku.ca" target="_blank"><span class="SpellE">Neal</span> <span class="SpellE">Madras</span></a> <br> FRSC, Department of Mathematics and Statistics York University Toronto <br> <br> <a href="mailto:mrioux@yorku.ca" target="_blank"><span class="SpellE">Marcia</span> <span class="SpellE">Rioux</span></a> <br> School of Health Policy and Management, Director, York Institute for Health Research York University Toronto, <br> <br> <a href="mailto:seyed.moghadas@nrc-cnrc.gc.ca%20" target="_blank"><span class="SpellE">Seyed</span> <span class="SpellE">Moghadas</span></a> <br> Department of Mathematics &amp; Statistics The University of Winnipeg Winnipeg <br> <br> <a href="mailto:ruan@math.miami.edu%20" target="_blank"><span class="SpellE">Shigi</span> <span class="SpellE">Ruan</span></a> <br> Department of Mathematics University of Miami <br> <br> <a href="mailto:bsahai@gov.mb.ca%20" target="_blank"><span class="SpellE">Beni</span> <span class="SpellE">Sahai</span></a> <br> Senior Scientist (Virology), Cadham Provincial Laboratory, Winnipeg, <br> <br> <a href="mailto:rsmith43@uottawa.ca%20" target="_blank"><span class="SpellE">Robert</span> <span class="SpellE">Smith</span></a> <br> The Department of Mathematics University of Ottawa <br> <br> <a href="mailto:pvdd@math.uvic.ca%20" target="_blank"><span class="SpellE">Pauline</span> <span class="SpellE">van den Driessche</span></a> <br> Mathematics and Statistics University of Victoria Department of Mathematics and Statistics University of New Brunswick <br> <br> <a href="mailto:lwang2@unb.ca%20" target="_blank"><span class="SpellE">Lin</span> <span class="SpellE">Wang</span></a> <br> Department of Mathematics and Statistics University of New Brunswick <br> <br> <a href="mailto:watmough@unb.ca%20" target="_blank"><span class="SpellE">James</span> <span class="SpellE">Watmough</span></a> <br> Department of Mathematics and Statistics University of New Brunswick <br> <br> <a href="mailto:webbgf00@ctrvax.vanderbilt.edu%20" target="_blank"><span class="SpellE">Glen</span> <span class="SpellE">Webb</span></a> <br> Mathematics Department Vanderbilt University Nashville <br> <br> <a href="mailto:Huaiping@mathstat.yorku.ca%20" target="_blank"><span class="SpellE">Huaping</span> <span class="SpellE">Zhu</span></a> <br> Laboratory for Industrial and Applied Mathematics Department of Mathematics and Statistics York University Toronto <br> <br> <a href="mailto:Ping_Yan@phac-aspc.gc.ca%20" target="_blank"><span class="SpellE">Ping</span> <span class="SpellE">Yan</span></a> <br> Surveillance and Risk Assessment Division Centre for Infectious Disease Prevention and Control Public Health Agency of Canada <br> <br> <strong><span style="color: black;"> Etudiants <o:p></o:p></span></strong> <br> <br> Le groupe encadre une trentaine d'étudiants et de post-doc : <a href="http://www.liam.yorku.ca/research/MADI/index.php?page=students"><em> Etudiants en PhD CDM MITACS </em></a></font></p> <p align="left"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><em><img src="Soumission2010_fichiers/here_rouge.gif" height="8" width="11"></em> Indiquez, pour chaque partenaire, les étudiants impliqués dans la proposition. Donnez une estimation de leur nombre et précisez si des thèses en cotutelle sont prévues <br> </font></p> <p align="left"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><img src="Soumission2010_fichiers/here_rouge.gif" height="8" width="11"> Equipe ANUBIS <font color="#666666"><br> </font> </font><br> Cette équipe-projet est consacrée au développement d outils de résolution numérique de problèmes généraux gouvernés par des équations aux dérivées partielles, et plus particulièrement ceux issus de la modélisation en Biologie.La modélisation et la simulation en Biomathématiques sont des domaines de recherche privilégiés de l équipe-projet. Les problèmes biologiques traités sont issus de la dynamique de populations (démographie, épidémiologie, hématologie) et des neurosciences. <br> <br> <a href="http://www.inria.fr/bordeaux/recherche/les-equipes-de-recherche/ANUBIS_page"><em> Le site ANUBIS </em></a></font> <br> <br> <strong><span style="color: black;"> Chercheurs impliqués <o:p></o:p></span></strong> <br> <br> Ce sont les chercheurs d'Anubis en épidémiologie : <br> Michel Langlais, University Bordeaux 2, Professor <br> Bedr'Eddine Ainseba, University Bordeaux 2, Professor <br> Arnaud Ducrot, University Bordeaux 2, Associate Professor (MCF) <br> <br> <strong><span style="color: black;"><o:p> Etudiants </o:p></span></strong> <br> <br> Pascal Zongo, University of Ouagadougou (Malaria) </p> <p align="left"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><img src="Soumission2010_fichiers/here_rouge.gif" height="8" width="11"> <font color="#000000">Historique de la collaboration entre les équipes</font></font> <font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><br> </font></p> <font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"> Les équipes MASAIE, ANUBIS et le CDM ont organisé une école d'été INRIA-MITACS à Yaoundé du 10 au 20 aout 2009. Ils vont organiser une école à Saint-Louis du 18 au 30 juillet 2010. MASAIE, ANUBIS et Julien Arino<br></font><div style="text-align: left;"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">participent à l'organisation d'EPICASA. <a href="http://www.inria.fr/nancy/rendez-vous/agenda/ecole-dete-mitacs-cdm-inria"><em> Ecole INRIA-MITACS </em></a></font> </div><p align="left"></p><div style="text-align: left;"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><img src="Soumission2010_fichiers/here_rouge.gif" height="8" width="11"> <font color="#000000">Insérez des liens vers les pages des personnes, laboratoires, organismes....</font></font> <br></div><p align="left"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"> <font color="#666666">/ Please copy the links towards relevant personal webpages, laboratories, home institutions, etc </font></font></p> <p align="left"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><b><font color="#990000">3. Impact </font></b><i>(1 page maximum</i>) <br> <font color="#663333">/ <strong>Impact</strong> <em>(maximum 1 page) </em></font></font></p> <p align="left"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"> Julien Arino sera accueilli un mois en avril 2010 au sein du projet MASAIE pour une recherche sur les modèles de métapopulation. Le MITACS avec MASAIE et ANUBIS vont développer des actions en direction du cameroun et de l'Afrique. Ceci dans le cadre du furur LIRIMA de l'INRIA. Un travail sur la malaria; à partir de la thèse de Zongho (ANUBIS) va commencer immliquant Arino, Ducrot et Sallet. <br> <br> Les modèles de métapopulation sont déjà un axe de recherche commun entre MASAIE et le CDM. Les chercheurs du CDM ont déjà commencé des recherches sur les résistances au médicaments, qui est un axe de MASAIE. Cela devrait profiter aux chercheurs et doctorants de MASAIE. <br> <br> Les chercheurs du CDM, de MASAIE et d'ANUBIS ont les mêmes intérêts de recherche. Leur collaboration, qui a déjà commencé devrait profiter à tous. Ces équipes sont complémentaires : MASAIE est spécialisé en ODE, alors que ANUBIS a une forte compétence en EDP. Par ailleurs le CDM MITACS comporte des expertises en stochastique et réseaux. Le CDM a de fortes connexions avec les utilisateurs finaux. MASAIE est très impliqué dans les maladies tropicales, ce qui intéresse le CDM ( voir école d'été à Yaoundé). Cette proposition d'équipe associée rassemble une forte masse critique de chrecheurs de ce domaine </font></p> <div align="left"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"> </font> <p><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><b><font color="#990000">4. Divers :</font></b> toute autre information que vous jugerez utile d'ajouter<font color="#663333"> <br> / <strong>Miscellaneous</strong>: <font color="#666666">any relevant information the applicant whishes to add</font></font></font></font></p> <font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">Cette équipe associée est l'occasion de développer leins entre l'INRIA et le MITACS dans le domaine de l'épidémiologie. </font> <hr><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"> </font></div> </div> <h2 align="left"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><font color="#000066" face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">II. PREVISIONS 2010</font><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><br> <font color="#666666">/ 2010 Forecast </font></font></font></h2> <h2 align="center"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><b><font color="#000066">Programme de travail</font></b><br> <font color="#666666">Work programme </font></font></font></h2> <div align="center"> <font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"> </font> <p><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">Description du programme scientifiquede travail <i>(1 à 2 pages maximum)<br> </i></font><em><font color="#666666" face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">/Description of the scientific work programme (maximum 1 to 2 pages) </font></em></font></p> </div> <h3 align="center"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">&nbsp;</font></h3> <h2 align="center"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><font color="#000066" face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><b>Programme d'échanges avec budget prévisionnel</b></font><br> <font color="#666666" face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">Exchanges schedule and estimated budget </font></font></h2> <p align="justify"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><b><font color="#990033">1.</font> <font color="#990000">Echanges</font></b> <font color="#663333">/ Exchanges </font></font></font></p> <p align="justify"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><img src="Soumission2010_fichiers/here_rouge.gif" height="8" width="11"> Julien Arino étant en sabbatique en 2010, il serait intéressant de l'accueillir quelques mois dans les projets MASAIE et ANUBIS. Il doit venir un mois comme professeur invité dans MASAIE (acquis). G. Sallet et A. Iggidr sont invités au field Institute de Toronto pour y travailler avec Arino en août (workshop commun). Par ailleurs MASAIE, ANUBIS et le CDM organisent une école d'été du 18 au 30 juillet 2010 à Saint-Louis (Sénégal) ;<br> <br> <br> <br> <br> <br> <table style="width: 75%;" border="1" cellspacing="0"> <tbody> <tr bordercolor="#CCCCCC"> <td bgcolor="#cccccc" width="30%"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif" size="2">&nbsp;<strong>1. ESTIMATION DES DÉPENSES EN MISSIONS INRIA VERS LE PARTENAIRE<br> <font color="#666666">Estimated spending for missions of INRIA researchers abroad </font></strong></font></td> <td bgcolor="#99cccc" width="12%"> <div align="center"> <p><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">Nombre de personnes<br> </font><font color="#666666" face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">Number of persons</font> </p> </div> </td> <td bgcolor="#99cccc" width="25%"> <div align="center"> <p><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">Coût estimé<br> </font><font color="#666666" face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">Estimated cost </font></p> </div> </td> </tr> <tr bordercolor="#CCCCCC"> <td bgcolor="#99cccc"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">Chercheurs confirmés<br> <font color="#666666">Senior researcher </font></font></td> <td>2</td> <td>4&nbsp;000 ¬ </td> </tr> <tr bordercolor="#CCCCCC"> <td bgcolor="#99cccc"> <p><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">Post-doctorants<br> <font color="#666666">Postdoctoral fellow </font></font><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><br> </font></p> </td> <td>1</td> <td>2&nbsp;000 ¬ </td> </tr> <tr bordercolor="#CCCCCC"> <td bgcolor="#99cccc"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">Doctorants<br> <font color="#666666">PhD student</font> </font></td> <td>2</td> <td>4&nbsp;000&nbsp;¬ </td> </tr> <tr bordercolor="#CCCCCC"> <td bgcolor="#99cccc"> <p><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">Stagiaires </font><br> <font color="#666666" face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">Intern</font></p> </td> <td>&nbsp;</td> <td>&nbsp;</td> </tr> <tr bordercolor="#CCCCCC"> <td bgcolor="#99cccc"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">Autre (précisez) : Ecole d'été Sénégal<br> <font color="#666666">Other (detail): </font><br> </font></td> <td>4</td> <td>10 000&nbsp;¬ </td> </tr> <tr> <td bordercolor="#FFFFFF"> <div align="right"><font color="#cccccc" face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">&nbsp;&nbsp;</font> <font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><strong>Total</strong></font></div> </td> <td bordercolor="#CCCCCC" bgcolor="#ccffff"></td> <td bordercolor="#CCCCCC" bgcolor="#ccffff">20 000 ¬ </td> </tr> </tbody> </table> </font></font></p> <p><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">&nbsp;</font></font></p> <table border="1" cellspacing="0" width="75%"> <tbody> <tr bordercolor="#CCCCCC"> <td bgcolor="#cccccc" width="30%"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif" size="2">&nbsp;<strong>2. ESTIMATION DES DÉPENSES EN INVITATIONS DES PARTENAIRES<br> <font color="#666666">Estimated spending for invitations of Partner researchers in France </font></strong></font></td> <td bgcolor="#99cccc" width="12%"> <div align="center"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">Nombre de personnes</font><br> <font color="#666666" face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">Number of persons</font></div> </td> <td bgcolor="#99cccc" width="25%"> <div align="center"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">Coût estimé</font><br> <font color="#666666" face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">Estimated cost </font></div> </td> </tr> <tr bordercolor="#CCCCCC"> <td bgcolor="#99cccc"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">Chercheurs confirmés<br> <font color="#666666">Senior researcher </font></font></td> <td>2</td> <td>5&nbsp;000 ¬ </td> </tr> <tr bordercolor="#CCCCCC"> <td bgcolor="#99cccc"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">Post-doctorants<br> <font color="#666666">Postdoctoral fellow </font><br> </font></td> <td>&nbsp;</td> <td>&nbsp;</td> </tr> <tr bordercolor="#CCCCCC"> <td bgcolor="#99cccc"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">Doctorants<br> <font color="#666666">PhD student</font></font></td> <td>2</td> <td>5 000&nbsp;¬ </td> </tr> <tr bordercolor="#CCCCCC"> <td bgcolor="#99cccc"> <p><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">Stagiaires<br> </font><font color="#666666" face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">Intern</font></p> </td> <td>&nbsp;</td> <td>&nbsp;</td> </tr> <tr bordercolor="#CCCCCC"> <td bgcolor="#99cccc"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">Autre (précisez) :</font><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">Ecole d'été Sénégal</font></font></font><br><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"> <font color="#666666">Other (detail): </font><br> <br> </font></td> <td>7&nbsp;</td> <td>20 000&nbsp;¬ </td> </tr> <tr> <td bordercolor="#FFFFFF"> <div align="right"><font color="#cccccc" face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">&nbsp;&nbsp;</font> <font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><strong>Total</strong></font></div> </td> <td bordercolor="#CCCCCC" bgcolor="#ccffff"></td> <td bordercolor="#CCCCCC" bgcolor="#ccffff">30 000¬ </td> </tr> </tbody> </table> <p align="left"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><b><font color="#990033">2.</font> <font color="#990000">Cofinancement</font></b> <font color="#663333">/ Cofinancing </font></font></font></font></p> <p align="left"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">Cette coopération a bénéficié pour l'organisation de l'école d'été en 2009 de 8000 ¬ de la DRI de l'INRIA, de 30 000 USD du MITACS (approximativement 20 000¬ ) et de 10 000¬ de l'IRD. <br> Dans le cas où notre proposition serait retenue, nous devrions obtenir 10 000 euros de l'IRD ainsi que 30 000 USD du MITACS pour l'organisation de l'écoe d'été MITACS-INRIA de 2010. <br> <em><br> </em><font color="#666666">/ Is this collaboration already supported by INRIA, by the partner institution or by a third party <em>(European project, National Science Foundation, etc)</em>? Please indicate the related amount of funding. <br> If this application is successful, would the partner institution also support this project? To what amount? </font></font></font></font></p> <p align="left"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><b><font color="#990033">3.</font> <font color="#990000">Demande budgétaire</font></b></font> <font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><font color="#663333">/ Proposed budget </font></font></font></font></p> <p align="left"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">Indiquez, dans le tableau ci-dessous, le coût global estimé de votre projet et le budget demandé à la DRI dans le cadre de cette Equipe Associée (maximum 20 K¬ ).</font></font></font></p> <p align="left"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">Avant de remplir le tableau, consultez les règles au paragraphe "Financement" de la <a href="http://www-direction.inria.fr/international/Page_Programmes.php?prog=ea">page d'accueil du programme</a>. </font></font></font></p> <p align="left"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><font color="#666666">/ Fill in the table below with your project's global estimated budget (A), other sources of funding (B), and the contribution asked from INRIA International Affairs Department under the Associate Team Programme (A - B).<br> Please refer first to the funding conditions stated in the "funding" paragraph of the <a href="http://www-direction.inria.fr/international/Page_Programmes_en.php?prog=ea">Associate Team programme presentation</a></font></font>.</font></font></p> <table border="1" cellspacing="0" width="76%"> <tbody> <tr bgcolor="#99cccc"> <td width="79%"> <div align="center"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><b>Commentaires</b></font></div> </td> <td width="21%"> <div align="center"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><b>Montant</b></font></div> </td> </tr> <tr> <td><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><b>A.</b> Coût global de la proposition (<i>total des tableaux 1 et 2 : invitations, missions, ...</i>)<br> <font color="#666666">A. Global cost of the collaboration project </font><br> </font></td> <td>50 000 ¬ </td> </tr> <tr> <td><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><b>B.</b> Cofinancements utilisés (<i>financements autres que Equipe Associée</i>)<br> <font color="#666666">B. Cofinancing (other than Associate Team programme)</font> </font></td> <td>30 000 ¬ </td> </tr> <tr bgcolor="#ccffff"> <td> <div align="right"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><strong>Financement "Équipe Associée" demandé <b>(A.-B.)<br> <font color="#666666">Funding from the Associate Team programme </font></b></strong><br> (maximum 20 000 ¬ ) </font></div> </td> <td>20 000 ¬ </td> </tr> </tbody> </table> <p><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">&nbsp;</font></font></p> <p><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">&nbsp;</font></font></p> <font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"> </font></font> <div class="basnavig" align="right"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"> </font></font></div> <div class="infos" align="center"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><font face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif"><font color="#666666" face="Verdana, Arial, Helvetica, sans-serif">© INRIA - mise à jour le 17/09/2009</font></font></font></div> </body></html>